In Erbarme Dich wordt u meegenomen in een labyrintische reis door het decor van een verlaten kerk met verhalen van mensen over hun bijzonder verhouding met de Matthäus Passion van Bach. De personen (waaronder Anna Enquist en Peter Sellars) doen verslag van hun bijzondere verhouding met Bachs muziek, omringd door de solisten van The Bach Choir & Orchestra of the Netherlands van dirigent Pieter Jan Leusink,
Orkest, solisten en koor van dirigent Pieter Jan Leusink voeren de Matthäus Passion op en begeleiden de verhalen met hun muziek. Met een pijnlijke levensgeschiedenis waarin het muziekstuk een allesoverheersende rol heeft gespeeld, is Leusink zelf ook een van de hoofdpersonen. Hij leeft voor de Matthäus Passion, terwijl hetzelfde muziekstuk heeft gezorgd voor een breuk tussen hem en zijn zeer gereformeerde vader.
Ramón Gieling regisseerde eerder Over Canto, de documentaire over het muziekstuk Canto Ostinato van componist Simeon ten Holt en de documentaire Johan Cruijff: en un momento dado.