De Amerikaanse kinderpsychiater Marianne Winter (Thekla Reuten) verhuist naar Schotland na de dood van haar man. Hier krijgt zij een nieuwe patiënt, het tienjarige jongetje Manny. Hij maakt tekeningen van traumatische gebeurtenissen en hij beweert dat hij de realiteit kan veranderen. In de eerste instantie gelooft Marianne er niks van, maar wanneer de tekeningen van Manny invloed beginnen te hebben op haar eigen leven verliest ze langzaam haar grip op de realiteit.
Regisseur Elbert van Strien won eerder de prijs voor beste film op het internationale filmfestival Fantasporto met zijn psychologische thriller Zwart water. Met Marionette begeeft hij zich opnieuw succesvol in het genre van de psychologische thriller.
